Diario
- -- 午前中はPopulation Genetics, 数万年のレベルでのdivergence timeの算出が印象的。午後はMolecular Ecology and Evolution、キャンセル多い、Avicenniaの研究で我々のと似たような結果が報告されていた。Encontre FJM.
- -- Registration。宿舎で仕事。夜はMixerに参加。Me olivido participar al excursion.
- -- SFOでT君と無事に落ち合う。次のフライトはdelay.CSU到着。21:00でもまだ明るい。
- -- Reviewのつづき。留学生関係の手続きと連絡数件。学会準備。
- -- 前期成績登録作業。研究連絡数件。昼は教室会議。国費留学生関係の書類作成。T君学会発表の相談。情報授業のプレゼン発表１位への賞状作成。理学部親和会。
- -- 事務書類作り、国費留学生関係の書類作成など。情報授業で学生への補習。W君T君とAFLPデータ解析の相談。
- -- ゼミ、卒研生が連続で経過報告、それぞれに個性あふれる発表。S君輪読はおやすみ。午後は長い会議。W君T君とGeneMapperによるAFLPデータ解析の相談。Me parece que W esta divertido la vida con sus companelas.
- -- 輪読はT君が担当、さすがに分かりやすい説明で、すんなり進む、K君の方も集団遺伝のわかりにくい概念を、なんとか説明しきった。S君本読み。進化生物学の採点集計と、追試・追レポへの対応。１年チューター授業は質問コーナー、いろいろと細かい質問に答える、情報授業の感想を聞くと、やはり、課題が大変だったとのこと。
- -- 情報授業の課題用データ集計。会議のための資料作り。成績評価に関する学生からの質問に対応。午後は長い会議、夜まで。
- -- 情報授業レポートの採点と集計、授業準備。S君輪読は今日も全く余裕なく、キャンセルしてもらう、申し訳ない。ギリギリまで授業準備、約束通りW君らに貰ったかりゆしウェアーを着て授業、PowerPointによる発表は、皆、大変素晴らしい発表だった。夕刻、研究室でK君作ニョッキをいただきつつしばし歓談。明日の会議の準備。
- &new([nodate]){date}: Invalid date string; -- 試験採点、授業直前までかかる、答案返却はS君にヘルプお願い。授業後、単位取得について、学生への個別の対応。Mさんと実験の進め方について相談、cpDNAでもデータはでそう。環境保全委員のお仕事。翌日の授業準備などなど。
- -- ゼミ準備。環境保全委員のお仕事。ゼミ。進化生物学の試験採点。
- -- T君論文の相談、イントロでの論理展開を整理。話しを詰めようとしていたところ、環境保全委員のお仕事で午前中はつぶれる。S君本読み、琵琶湖関係の論文調査についての相談。試験採点開始、あまりの暑さに、クーラーの入っている実験室で仕事。
- -- 植物学会HP委員会報告書作り。情報授業、レポート採点と授業アンケート集計＋授業準備、今回のSQLは１時間の授業で説明するのは無理なのかと不安になってくる。授業はやはり、ダウンロードしたファイルの置き場所、コマンド入力の正確性など、様々なハードルがある、TAのW君もかなり苦労していた。Bebemos cervesas belgicas con estudantes.
- -- 試験問題作成はぎりぎりまでかかった。進化生物学の試験、問題量は多かったが全体的にできはよさそう。レポート採点、ようやく終了。授業時間内に試験を受けられなかった人への対応。明日の授業準備。
- -- ゼミ、Wさん発表、いろいろと忙しいはずなのに、ちゃんと勉強してまとめてらっしゃるのは流石。中間発表はTさんとS君。Tさんは、T君の指導のおかげもあってデータが順調に出てきている。S君は実験計画がようやく形になってきた、今回、いろんな意見をもらって、さらに改善されるだろう。午後は環境保全委員関係で試薬整理のお仕事、T君・W君にヘルプを頼む。試験問題作成、なかなかすすまず一苦労、今日も徹夜になりそう。
- -- 土日と授業準備。SQLiteを教材に使いたいのだが、適当な管理ツールが無く、一苦労、PHPのバージョン、SQLiteのバージョン、あれこれ試すがだめ。試験準備とレポート準備、あまりすすまず。チュータ授業は論文で使われている最尤法の説明。S君とイシガイシーケンスのアラインメント。
- -- レポート採点。学生から授業やレポートに関する質問受付。試験準備。出張手続き等事務手続きいろいろ。
- -- 授業準備。午前中はNさん科研の打ち合わせ会議。午後は授業、DNAデータベースの検索とデータダウンロード、配列のアラインメント、系統樹作成まではわりとすんなり行く、仮想サーバの設定には、少々手こずる人も。レポート採点のべ３週分とレビュー１件、溜まってしまった。
- -- 授業準備は直前までかかる、レポート採点終わらず、授業は最尤法の続きと、系統推定全体のまとめ。情報授業の準備、授業内容がだんだん高度なものになってきたので、準備に時間がかかる。こちらもレポート採点終わらず。
- -- ゼミ。K君発表は東アジアと北米西部の隔離分布の話し、系統解析とDIVAを使った起源地推定など。S君本読みと研究計画の相談、予備実験は順調に進んでいるよう。午後は学会関係の連絡。学会出張航空券の予約は出遅れたため一苦労。授業準備。
- -- 輪読。M君系統推定のところ、Tさん島嶼における種分化。昼はS君本読みの予定が、途中で学会受付関係の急な仕事が入り、作業。チュータ授業の論文読みは、METHODSの所に入って学生さんは大変そう。W君学会要旨にコメント。学会受付関係の作業を夜中まで。
- -- 学会HP受付システムの調整、動画画像等登録システムの変更とCGI作成。
- -- 学会HPの大会受付に問題発生。T君と要旨や調査などの相談。W君と学会要旨の件相談。
- -- T君と学会要旨などいろいろ相談。情報授業の準備、教育情報システムの利用法でいくつか不明点があり、情報教育基盤センターで実際に操作を試す、授業準備にギリギリ間に合う。授業は先週の続きで、遺伝的浮動のプログラミング、前回よりは理解して貰えたよう。植物学会HP関係のお仕事。
- -- 授業準備、最尤法の授業で、0,1マトリクスを使って最尤系統樹を探すという演習を作成、少しはどんなことをやっているかという実感がわくのでは無いかと期待。授業、受験以来確率とかはあまり使っていないようなので、理解するのは大変だったよう。S君本読み、研究の進め方について相談。情報授業の準備、授業で使うXitami, PHP, SQLiteの動作確認、いずれも少し設定をいじれば動作した。授業レポート採点と集計、プログラミングの課題はほぼ全員できていたが、難しいという声も多い。W君、T君、学会発表要旨にコメント。
- -- 学会HP関係お仕事。ゼミ、M君経過報告など。S君本読み。環境保全関係会議。授業準備、資料作成。T君とマングローブ関係の結果について相談、4月から始めた実験で、ほぼ見通しが立った、年内投稿を目指す。
- -- T君と論文の相談、預かりっぱなしになっていた論文、読んだところまでとりあえず返却。輪読、声があまり出せないので、コメントは院生以上の方々に任せる。W君とデータ解析の相談、GeneMapperで解析の確認をやることに。M君、経過報告を聞く、実験の進め方と解析方法について相談。1年生チュータ授業、論文は結果の部分に入り、専門用語の理解に苦労しているよう、内容解説と、知らない用語に出会ったときの対処法を説明。授業準備、レポート採点、最尤法説明資料未完成。
- -- 情報授業で質問の多かった帰無仮説と仮説検定の補助説明資料作成、プログラミング演習の説明資料も新たに付け加えた。1年チューター授業の説明更新。サーバのメンテナンス作業。進化生物学授業での最尤法の授業計画、二値形質で置換モデルを適当につくって、３分類群で手計算が可能かどうか検討。
- -- T君と論文作成の相談、今回はAssignment Testの結果を見せてくれた、さすがに素早い、こちらも負けずに読み進まねば。学部学生の質問に対応、皆さんなかなか勉強熱心。進化生物学のレポート返却、ようやく終了。レビュー引き受け。K君予定していた論文紹介の論文、図書館から届かず、急遽相談して別の論文に変更。
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