授業/H21/系統学特論のバックアップ(No.1)

バックアップ一覧
差分を表示
現在との差分を表示
ソースを表示
授業/H21/系統学特論へ行く。
- 1 (2009-04-13 (月) 15:50:06)
- 2 (2009-04-21 (火) 12:09:49)

系統学特論 †

授業コード：
対　象：　地球生命圏科学専攻
場　所：　理学部１号館１階セミナー質
時　間：　火曜・３限
実施日：　初回開講日：4月 21日
担　当：　綿野　泰行・梶田　忠

注意事項： †

※　講義室で行う講義は全部で６回です。それ以外の週は、個別指導を受けて課題をこなし、レポートとして提出します。
※　授業には、できる限りインターネットに接続できるノートパソコンを持参してください。授業の詳細については、下記ホームページを見て下さい。

http://bean.bio.chiba-u.jp/lab/　「授業/H20/系統学特論」
初回授業にはガイダンスを行いますので、必ず出席してください。出席できない場合は、担当教員に連絡して、個別に指導を受けてください。
※連絡先：
- 綿野（内線2819, watano@faculty.chiba-u.jp), 理3・406号室
- 梶田（内線2818, ), 理3・407号室

↑

分子系統学の授業の進め方 †

1）実際にコンピューターからデータを検索・ダウンロードしたり、分子進化・系統解析用のソフトウェアを使って、実感しながら系統推定の実際を学ぶ。
2）授業で説明をうけたら、次回の授業までに各自でデータを解析。各自必要に応じて個別指導を受け、レポートにまとめる。メールに添付して提出。
3）この作業を5回ほど繰り返す。

↑

内容 †

第1回目(4月21日)：ガイダンス: Guidance
- 使用するプログラムの入手法: Instruction for usage of the computer system and ways for obtaining softwares.

第2回目以降の予定は初回ガイダンスで示す

↑

リンク †

各ソフトウェアのウェブページへのリンクです。インストール方法の説明や、ドキュメント類、最新版が置かれています。

Phylogenetic Trees Made Easyのウェブサイト　http://www.sinauer.com/hall/

Mega http://www.megasoftware.net/mega.html

Bioedit http://www.mbio.ncsu.edu/BioEdit/bioedit.html

DNAsp http://www.ub.es/dnasp/

Clustalx http://www-igbmc.u-strasbg.fr/BioInfo/ClustalX/Top.html

Modeltest http://darwin.uvigo.es/

PHYLIP http://evolution.gs.washington.edu/phylip.html

PAUP* http://paup.csit.fsu.edu/

MESQUITE http://mesquiteproject.org/mesquite/mesquite.html

授業/H21/系統学特論 のバックアップ(No.1)

系統学特論 †

注意事項： †

分子系統学の授業の進め方 †

内容 †

リンク †

授業/H21/系統学特論のバックアップ(No.1)