最(大)節約法: Maximum Parsimony Method

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予備知識確認テスト

授業を開始する前に、次の問いに答えてもらいます。

Table 1.

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系統樹の表記法(ニューイックフォーマット, Newic Formst)

下の系統樹は (M(N(A(B C)))) と表記する。

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第5回:7月6日授業課題

NEXUSファイルの生成までをウェブベースで行う方法

課題の提出期限:7月13日

授業/H17/系統学特論/PAUPブロック

最節約法の基礎

最節約法を基本から勉強したいという人には、次の参考書(なんと無料!)をお勧めします。1コマの講義で節約法の全貌と、ソフトウェアを使った系統推定を理解するのは、初めての人には大変だと思います。以下の文献よ読んで、復習してください。

The Compleat Cladist (日本語訳が「系統分類学入門」というタイトルで、文一総合出版から出ている)http://taxonomy.zoology.gla.ac.uk/teaching/CompleatCladist.pdf

Basics of Cladistic Analysis (上よりもさらに簡単な内容)http://www.gwu.edu/~clade/faculty/lipscomb/Cladistics.pdf