*開　講　通　知　（平成26年度後期集中授業） [#g330a4d1]

科目名：　系統解析論~
対　象：　地球生命圏科学専攻・博士後期課程~
科目名：　系統解析論~
開講日：2015年　1月9（金）， 14（水）、 15日（木）, 16日（金）~
（隔年開講につき、H27年度は開講しません）~
場　所：　未定~
場　所：　自然科学1号館４階セミナー室~
担　当：　梶田　忠・高山浩司（東京大学総合研究博物館）~
時　間：　下記の通り~
　　　1月 9日（金）	10:00-(午前・午後) :~
　　　　　　　「系統解析の実際と応用」（梶田）~
　　　1月 14日（水）	10:00-(午前・午後) :~
　　　　　　　「分子データを用いた系統解析・系統地理学的解析」（高山）~
　　　1月 15日（木）	10:00-(午前・午後)　 :~
　　　　　　　「分子データを用いた系統解析・系統地理学的解析」（高山）~
　　　1月 16日（金）	10:00-(午前・午後) :~
　　　　　　　　「系統解析の実際と応用」（梶田）~
~
注意事項：~
※受講者は12月20日までに、必ず、受講確認メールを梶田まで送って下さい。~
※授業では実際にノートパソコンを操作します。　受講者は無線LANに接続可能なノートパソコンを授業に持参してください。~
　準備しておくべきソフトウェアの詳細などは、受講確認メールへの返信と、~
　下記ウェブページで連絡します。~
※連絡先　梶田（内線2818, tkaji@faculty.chiba-u.jp)~
高山  (takayama@um.u-tokyo.ac.jp)~
ウェブページ　http://bean.bio.chiba-u.jp/lab/　「授業/H26/系統解析論」~
~

**受講生への連絡：　ANNOUNCEMENT [#ja1fedc5]
■梶田担当分について~
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私の担当分では、系統解析を実際に行っていただきます。ノートパソコンが必要になりますので、持ってきてください。ワイヤレスLANが使える方が良いです。解説はMacintoshを用いて行います。
~今回の授業では、最初にUnixライク環境を各自のパソコンに構築するところから始めます。次に、Windows環境とUnix-like環境を用いて、様々な解析を実際に行います。
~
H19年度には、以下のような解析を行いました。
-[[Mesquiteを用いた祖先形質状態の復元>授業/H19/系統解析論/Mesquite]]
-Arlequin3のインストールと、プロジェクトファイルの作成。ハプロタイプと集団を用いた解析についての解説。
-[[Cygwinを用いたUnixライク環境の体験>授業/H19/系統解析論/cygwin]]
-[[複数領域のデータを連結し、領域ごとに異なるモデルを選択してベイズ解析>授業/H19/系統解析論/REST/mrbayes]]（書きかけ項目につき制限ページに移動）

質問などはメールで受け付けますし、部屋に訪ねていただいても構いません。~