授業/H20/情報処理のバックアップ(No.19)

普遍授業：情報処理 - 生物学で必要なコンピュータスキル †

普遍授業：情報処理 - 生物学で必要なコンピュータスキル

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講義データ †

2008・前期・木５, 1年次対象（1S生）, 2単位
講義・実習, 授業コード G2100126 , 科目コード G121001
授業科目名情報処理（Information Processing）、副題：生物学で必要なコンピュータスキル
教室等Ａ5F情報処理演習室１
担当教員梶田　忠（理学部３号館407号室内線番号 2818）
授業概要生物学を学ぶ上で、コンピュータを効率的に利用して情報の収集、加工、解析、整理、発信を行うことは、必要不可欠である。この講義では、生物学科の学生が求められる、コンピュータを使うための基本的な技術と知識を習得する。
目的・目標
この講義では、普遍教育が掲げる目的のうち、特に、「幅広く深い教養」と「総合的な判断力」の育成に必要な情報処理技術の習得をめざしている。習得目標（習得を目指す知識とスキル）は以下の通り。
- 論文やプレゼンテーションの作成に必要なコンピュータ利用の知識と技術を習得する。
- 目的に合致したソフトウェアを選択し、使用できるようになる。
- テキストデータの利用に習熟する。
- 異なるソフトウェアの間で、データの共有や移動ができるようになる。
- 大量のデータをコンピュータに自動処理させる方法を習得する。
- ネットワークを用いてコミュニケーションを行うことができるようになる。
- ネットワークの基本的な仕組みを理解する。
- 基本的な統計解析の方法とプログラミングの基礎を習得する。

授業計画・授業内容授業計画は以下の通りだが、習得状況によって進行速度や実施内容は調節する。前半は計算機システムにインストールされているMS Officeなどの基本アプリケーションの解説を行う。後半は様々なデータ処理に必要なソフトウェアを自分でインストールして操作する。
授業はウェブイト（本ページ）を各自のモニターで参照しながら行う。また、個別のアプリケーションの操作は、前方スクリーンを用いて解説する。課題の提出と教員と個別のコミュニケーションは、主に授業用Pukiwikiページ（認証付き・非公開）を用いて行う。

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講義実施予定と獲得目標（習得状況によって微調整） †

第1回　教育用端末、履修登録、電子メールの利用説明、アンケート。
1. 教育用端末へのログインし操作できるようになる
2. 履修登録システムの使用方法を習得する
3. 大学の電子メール（統合メールシステム）を使ってメール送信ができるようになる
4. コピー・ペーストの方法を習得する
第2回　コンピュータによるコミュニケーション。メールによる添付書類のやり取り。ファイルの種類と拡張子の表示。MS Wordの起動と終了。レポート作成に一般的注意。K2Editorのインストール。
1. 統合メールを使って、添付書類つき電子メールを送受信できるようになる
2. MS Wordを使ってファイルを開いて編集し、保存できるようになる
3. Windows XPのシステムで、ファイルの拡張子を表示できるようになる
4. レポートが教員と学生のコミュニケーションの１つであることを理解する
第3回　テキストファイルを用いたアプリケーション間のデータ交換の概要（Word, ブラウザ, テキストエディタ））, Pukiwikiによる情報共有
1. Pukiwikiによるページの作成方法を覚える
2. テキストデータ（テキストファイル）とは何かを理解する
3. テキストエディタの基本的な使い方（テキスト入力、検索、置換）を体験する
4. 異なるアプリケーションでテキストデータを共有する方法を体験する（テキストエディタとエクセル等）
第4回テ　キストファイルの加工と正規表現、マイクロソフト御三家（Word, Excel, PowerPoint）の解説、特にExcel。
1. ウェブページ経由で送信されるデータの種類を知り、セキュリティに関心を持つ
2. 正規表現とはどのようなものかを理解し、テキストエディタによる正規表現検索、置換の便利さを実感する
3. テキストエディタとエクセルの間でのデータの共有方法を習得する
4. エクセルによる簡単な表計算方法を習得する
第5回　Excelによるグラフ作成。大量のデータが何を語っているかを、並び替え、集計、グラフ化によって導き出す。
1. 正規表現検索・置換とエクセルの操作に習熟する
2. エクセルによるデータの並び替え方法を習得する
3. エクセルによるデータの集計方法を習得する
4. エクセルによるグラフ作成方法を習得する
第6回　Wordによる文書作成、WinShotを用いた画像データの取り込み。レポートの見栄えを良くする方法。Pukiwikiページへの画像の貼り付け。班毎のプロジェクトについて、進め方説明。授業で必要なソフトウェアのダウンロードとインストール方法の解説。
1. エクセルによるデータの並び替え・集計・グラフ作成に習熟する
2. 正規表現:後方参照に挑戦する
3. Wordを使った文書作成を習得する
4. Winshotを使った画像の切り取り
第7回　WordとPower Pointによる文書作成。画像データを取り込む場合の注意。
1. WinShotを用いたスクリーンキャプチャの方法に習熟する
2. 正規表現:後方参照に慣れる
3. Wordを使った文書作成に習熟する
4. WordとPower Pointで共通する図の編集操作を習得する
第8回　Power Pointを使ったプレゼンテーション作成　− 論文紹介プレゼン作成 −
1. 正規表現:後方参照の復習
2. 論文データベースを使った研究論文の検索を体験
3. プレゼンテーション作成におけるPower Pointの基本操作を習得する
第9回　　Rを使ったデータ解析：基本的な数値計算と様々な統計処理
1. Rの基本操作を理解する
2. Rを使って数値計算を行うことができるようになる
3. Rを使った簡単な統計解析とシンプルなグラフを作成できるようになる。
4. Rを使った統計的検定の方法を理解する
第10回　Rを使ったプログラミング演習
1. プログラミングとは何かを理解する
2. プログラミングにおける繰り返しと代入と条件分岐を習得する
3. ユーザー定義関数を理解する
4. Rで基本的なプログラムを作成し、実行できるようになる
第11回　　Rを使ったプログラミング演習・Rを用いたシミュレーション
1. プログラミングの基本：繰り返し・代入・条件分岐に習熟する
2. ユーザー定義関数を理解する
3. シミュレーションの考え方を習得する
4. シミュレーションのプログラミングを体験する
第12回　 DNAデータベースの利用。塩基配列データのアラインメントと解析。系統解析に挑戦
1. DNAデータベースにアクセスし、キーワードやアクセッション番号で配列データを検索する方法を習得する
2. 塩基配列を用いてデータベースを検索し、よく似た配列データを検索するを習得する
3. ダウンロードしたDNAの塩基配列データをアラインメント（整列）し、系統樹作成等の解析に用いる方法を習得する
第13回　リレーショナルデータベースの利用（SQLite）。データベース、テキストファイル、Excelなどの組み合わせによる情報の整理と統合。Webを介した情報の流れ
1. リレーショナルデータベース（SQLite）をインストールして、操作出来るようになる。
2. SQLiteを使って、情報の検索・抽出・並び替え・複数テーブルの結合に挑戦する
3. ウェブページを利用するときに、どのようにして情報が伝達されているかを理解する
4. HTMLを用いて自分でウェブページを作成し、インターネットに公開できるようになる
第14回　班ごとのプロジェクト、成果発表。Power Pointによるプレゼンテーション。１班7-9分。
1. PowerPointを使ってプレゼンテーションを行う
2. 評価項目に従って、それぞれのプレゼンテーションを評価する
第15回　図書館情報システム講習（文献データベース検索、電子ジャーナルの利用など）