授業/H24/進化生物学I のバックアップ(No.3)

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- 1 (2012-04-18 (水) 08:58:19)
- 2 (2012-04-18 (水) 09:02:56)
- 3 (2012-04-24 (火) 16:22:21)

進化生物学I †

進化生物学I
- 授業情報

授業情報 †

H24(2012)年度授業コード:S4229101 科目コード:S42291
前期・水２単位数 :2　　専門科目（生物学科）　教室理学部大講義室
授業科目名: 進化生物学I　（Evolutionaty Biology I）, 副題進化学・系統学の基礎
担当教員梶田　忠, 連絡先研究室理学部3号館407号室 , 内線番号 2818
メールアドレス

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目的・目標 †

進化（evolution）は生物学における最も基本的な現象の一つであり、進化学的な考え方を習得することにより、生物界の様々な現象が理解できるようになる。本講義では、生物進化の基礎的な考え方、進化的現象とその機構、生物進化の歴史とその推定法について、基本的な知識や知見を学ぶ。系統樹を用いた進化の歴史の理解と系統推定法には特に重点を置く。

キーワード Tree Thinking, 進化、系統、系統推定、系統樹、分子進化、分子系統学

講義内容

Tree Thinkingの基礎。重要用語の理解、系統推定の基礎・最節約法、最節約法・形質の最節約配置
系統樹の評価、距離行列法、分子進化のモデル、最尤法、ベイズ法、系統樹とその応用
生物地理学、系統地理学、系統分類学、系統樹を用いた実際の研究紹介

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講義予定 †

4月18日　講義ガイダンス：　Tree Thinking の紹介
4月25日　Tree Thinkingの基礎。重要用語の理解。
5月2日　
5月9日　　
5月16日
5月23日
5月30日
6月6日　　
6月13日　
6月20日　
6月27日　
7月4日　　＜海外出張のため休講＞→自習課題
7月11日
7月18日
7月25日

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評価方法・基準 †

成績はレポート及び小テストで評価する。出席点も考慮する。
レポートの提出および出席確認はmoodleを用いて行う。出席確認は、授業時間内に配布する授業出席コードを用いて行う。
進化生物学I　moodleサイト →http://bean.bio.chiba-u.jp/moodle

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参考書・参考ウェブページ †

Tree Thinkingウェブサイト http://www.tree-thinking.org/publications.html#science310
- このページのEVOLUTION: The Tree-Thinking Challengeというところに授業で用いた資料へのリンク（下記）が載っている：
  - 資料へのリンク：http://www.sciencemag.org/cgi/content/full/310/5750/979/DC1
  - 元論文はScience誌に掲載された：http://www.sciencemag.org/cgi/content/full/310/5750/979?ijkey=buAV20Wfap/76&keytype=ref&siteid=sci
Freeman, S. and Herron, J. C. 2004. Evolutionary Analysis. Pearson, Prentice Hall.
Ridley, M. 2004. Evolution. Blackwell Publishing.