*系統学特論掲示板 [#h3dfbeba]
**第3回目授業資料の誤植? [#vf306c72]
>[[山北]] (2005-05-24 13:48:34 (火))~
~
配布資料のファイルのダウンロードのほうのページ、~
たいしたことではないですが、おそらく~
誤: 正:~
D88068 -> D88086~
TAYSUGATAKE -> YATSUGATAKE(こっちは影響はしませんが)~
のようにするのが正しいと思います。~
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**授業スケジュールとルール [#la5e78c4]
>[[綿野]] (2005-05-09 20:27:02 (月))~
~
1)実際にコンピューターからデータを検索・ダウンロードしたり、分子進化・系統解析用のソフトウェアを使って、実感しながら系統推定の実際を学ぶ。~
2)授業で説明をうけたら、次回の授業までにレポートの提出(メールの添付でよい)~
3)この作業を5回ほど繰り返す。~
~
第1回目(4/26):ガイダンス~
・使用するプログラムの入手法~
~
第2回目(5/10 場所 理4号館 マルチメディア):~
分子進化と遺伝的浮動~
・中立突然変異が固定する機構~
・プログラム:エクセル~
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第3回目(5/24 自然2号館 マルチメディア):~
DNAデータベース:検索とダウンロード~
・DNAデータベースとファイルフォーマットの勉強~
・プログラム:メモ帳, ClustalX~
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第4回目(6/7 自然2号館 マルチメディア):~
塩基配列のアラインメントと簡単な系統樹作成~
・距離行列法~
・プログラム:Clustal X, BioEdit, neighbour.exe, TreeView~
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第5回目(6/21 自然2号館 マルチメディア):~
最節約法~
・最節約法の原理と実際~
・PAUP~
第6回目(7/5 自然2号館 マルチメディア):~
最尤法~
・分子進化のモデルと最尤法の実際~
・プログラム:ModelTest, PAUP~
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