授業/H17/系統学特論/掲示板

系統学特論掲示板 †

第3回目授業資料の誤植？ †

山北? (2005-05-24 13:48:34 (火))

配布資料のファイルのダウンロードのほうのページ、
たいしたことではないですが、おそらく
誤：　　　　　　正：
D88068　 -> D88086
TAYSUGATAKE -> YATSUGATAKE（こっちは影響はしませんが）
のようにするのが正しいと思います。

授業スケジュールとルール †

綿野? (2005-05-09 20:27:02 (月))

1）実際にコンピューターからデータを検索・ダウンロードしたり、分子進化・系統解析用のソフトウェアを使って、実感しながら系統推定の実際を学ぶ。
2）授業で説明をうけたら、次回の授業までにレポートの提出（メールの添付でよい）
3）この作業を5回ほど繰り返す。

第1回目（4/26）：ガイダンス
　　・使用するプログラムの入手法

第2回目（5/10　場所　理４号館　マルチメディア）：
分子進化と遺伝的浮動
　　・中立突然変異が固定する機構
　　・プログラム：エクセル

第3回目（5/24　自然2号館　マルチメディア）：
DNAデータベース：検索とダウンロード
　　・DNAデータベースとファイルフォーマットの勉強
　　・プログラム：メモ帳, ClustalX

第4回目（6/7　自然2号館　マルチメディア）：
塩基配列のアラインメントと簡単な系統樹作成
　　・距離行列法
　　・プログラム：Clustal X, BioEdit, neighbour.exe, TreeView

第5回目（6/21　自然2号館　マルチメディア）：
最節約法
　　・最節約法の原理と実際
　　・PAUP
第6回目（7/5　自然2号館　マルチメディア）：
最尤法
　　・分子進化のモデルと最尤法の実際
　　・プログラム：ModelTest, PAUP